MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016856	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016856	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016856	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016856	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016856	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448275
6	NC_016856	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448275
7	NC_016856	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016856	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016856	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016856	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
11	NC_016856	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378448276
12	NC_016856	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448276
13	NC_016856	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	378448276
14	NC_016856	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
15	NC_016856	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	378448276
16	NC_016856	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
17	NC_016856	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448276
18	NC_016856	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
19	NC_016856	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	378448276
20	NC_016856	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378448276
21	NC_016856	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
22	NC_016856	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
23	NC_016856	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448276
24	NC_016856	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
25	NC_016856	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
26	NC_016856	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448276
27	NC_016856	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448276
28	NC_016856	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378448276
29	NC_016856	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448276
30	NC_016856	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448276
31	NC_016856	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448276
32	NC_016856	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
33	NC_016856	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
34	NC_016856	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448276
35	NC_016856	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448276
36	NC_016856	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378448276
37	NC_016856	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
38	NC_016856	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
39	NC_016856	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448276
40	NC_016856	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448276
41	NC_016856	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448276
42	NC_016856	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378448276
43	NC_016856	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448276
44	NC_016856	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448276
45	NC_016856	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448276
46	NC_016856	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448276
47	NC_016856	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
48	NC_016856	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
49	NC_016856	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448276
50	NC_016856	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
51	NC_016856	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448276
52	NC_016856	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448276
53	NC_016856	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448276
54	NC_016856	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
55	NC_016856	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448276
56	NC_016856	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448276
57	NC_016856	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378448276
58	NC_016856	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378448276
59	NC_016856	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
60	NC_016856	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378448276
61	NC_016856	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448276
62	NC_016856	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448276
63	NC_016856	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448276
64	NC_016856	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378448276
65	NC_016856	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448276
66	NC_016856	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448276
67	NC_016856	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448276
68	NC_016856	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448276
69	NC_016856	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448277
70	NC_016856	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448277
71	NC_016856	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	378448277
72	NC_016856	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448277
73	NC_016856	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448277
74	NC_016856	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378448277
75	NC_016856	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448277
76	NC_016856	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448277
77	NC_016856	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448277
78	NC_016856	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448277
79	NC_016856	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448277
80	NC_016856	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448277
81	NC_016856	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378448277
82	NC_016856	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448277
83	NC_016856	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448277
84	NC_016856	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378448277
85	NC_016856	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378448277
86	NC_016856	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448277
87	NC_016856	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448277
88	NC_016856	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448278
89	NC_016856	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	378448278
90	NC_016856	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448278
91	NC_016856	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448278
92	NC_016856	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378448278
93	NC_016856	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448278
94	NC_016856	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448278
95	NC_016856	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378448278
96	NC_016856	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448278
97	NC_016856	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378448278
98	NC_016856	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448278
99	NC_016856	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448278
100	NC_016856	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448278
101	NC_016856	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448278
102	NC_016856	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448278
103	NC_016856	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448278
104	NC_016856	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448278
105	NC_016856	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378448278
106	NC_016856	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378448278
107	NC_016856	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	378448278
108	NC_016856	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448278
109	NC_016856	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448278
110	NC_016856	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378448278
111	NC_016856	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448278
112	NC_016856	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448278
113	NC_016856	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448278
114	NC_016856	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448278
115	NC_016856	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	378448278
116	NC_016856	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448278
117	NC_016856	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448278
118	NC_016856	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378448278
119	NC_016856	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448278
120	NC_016856	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448278
121	NC_016856	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016856	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378448279
123	NC_016856	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448279
124	NC_016856	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448279
125	NC_016856	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448279
126	NC_016856	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378448279
127	NC_016856	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	378448279
128	NC_016856	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448279
129	NC_016856	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448279
130	NC_016856	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448279
131	NC_016856	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448279
132	NC_016856	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378448279
133	NC_016856	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378448279
134	NC_016856	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448279
135	NC_016856	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378448279
136	NC_016856	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448279
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138	NC_016856	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448279
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141	NC_016856	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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253	NC_016856	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_016856	ATC	2	6	12094	12099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448287
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